L-cystein används huvudsakligen inom medicin, kosmetika, biokemisk forskning; Används i brödmaterial för att främja bildandet av gluten och främja jäsning, mögel och förhindra åldrande. Används i naturliga juicer för att förhindra oxidation av C-vitamin och förhindra att saften blir brun. Produkten har avgiftningseffekt, kan användas för akrylnitrilförgiftning, aromatisk acidos.
Acetylcystein, även känd som N-acetylcystein eller N-acetyl-L-cystein (NAC), är ett läkemedel som används för att behandla överdosering och för att lossa tjockt slem såsom vid cystisk fibros eller kronisk obstruktiv lungsjukdom.